根据新出台方案显示，普通本科院校可根据办学特色和定位，从6门普通高中学业水平等级性考试科目中，分学科大类(或专业)自主提出选考科目范围，但最多不超过3门。学生满足其中任何1门，即符合报考条件。对于没有提出选考科目要求的高等学校，学生在报考该校时无科目限制。选科打破了传统文理科界限，可在六门课中通选。从“3选1”的三种可能到“6选3”产生的20种组合，选择多了，空间大了，但无疑对学生和学校提出更高要求。
原来选“加一”科目中一个耐人寻味的现象是，在上海各类科技竞赛中，超过一半的学生参加生物项目，但在高考中加试生物的人却寥寥无几。在生物科目可报考专业限制这道坎前，学生的选择和兴趣脱钩。
上海市基础教育国际课程比较研究所所长唐盛昌分析，新方案下，高校提出的选科要求学生只需对上一门，一定程度上给他们留下了按个性兴趣特长选择的空间。不过，由于高校按学科大类提出报考条件，这对学生也提出新的要求，应该尽早对自己有个综合判断，既考虑自己的个性发展，又要考虑未来大学可能的发展方向。“学生可能还比较懵懂，这就对学校的指导提出较高要求。”